Agus Salim memperoleh gelar sarjana ekonominya dari Fakultas Ekonomi dan Bisnis, Universitas Indonesia di tahun 2000, dan gelar Master Ekonomi dari Program Pascasarjana Ilmu Ekonomi, Fakultas Ekonomi dan Bisnis, Universitas Indonesia di tahun 2006. Agus Salim telah bekerja menjadi peneliti di LPEM FEB UI sejak tahun 2001. Beliau juga pernah bekerja sebagai asisten dosen dibawah FEB UI di tahun 1999 sampai dengan tahun 2002. Sejak tahun 2006, Agus Salim merupakan dosen tetap di FEB UI. Minat penelitian beliau adalah Ekonomi Regional, Ekonomi Industri, Ekonomi Spasial, Statistika dan Ekonometrika
Pengalaman proyek penelitiannya mencakup Analisis Kebutuhan Fasilitas Industri untuk Kementerian Perindustrian pada tahun 2015, Perencanaan Fasilitas Industri untuk Meningkatkan Daya Saing Industri untuk Kementerian Perindustrian pada tahun 2014, dan Studi Industri Ekstraksi dan Ekonomi Lokal: Sebuah Kasus PT. Newmont Nusa Tenggara di Kabupaten Sumbawa Barat untuk SEADI-USAID pada tahun 2013.