Arianto A. Patunru meraih gelar Master of Science dari Departemen Ekonomi, University of Illinois at Urbana-Champaign (2000) dengan spesialisasi dalam Ekonomi dan Kebijakan Ekonomi Internasional. Ia memperoleh gelar PhD dari Departemen Ekonomi Pertanian dan Konsumen, University of Illinois at Urbana-Champaign (2004).
Selama menjabat sebagai Direktur Lembaga Penyelidikan Ekonomi dan Masyarakat, Arianto A. Patunru juga aktif sebagai dosen di Fakultas Ekonomi dan Bisnis, Universitas Indonesia. Pada tahun 2012, ia bergabung dengan Departemen Ekonomi Arndt-Corden, Crawford School of Public Policy, Australian National University.