Mohamad Ikhsan memegang gelar Master dari Vanderbilt University, AS pada tahun 1991 di bidang ekonomi moneter dan internasional. Pada tahun 1998, ia meraih gelar PhD dalam bidang ekonomi dari University of Illinois, dengan spesialisasi dalam Ekonomi Pembangunan dan Internasional.
Ia pernah menjadi Anggota LP3E – Kamar Dagang (1999-2005), Anggota Dewan Maritim Indonesia (1999-2007), Wakil Ketua Kelompok Kerja Ekonomi LEMHANAS (2000-2005), Komisaris Independen PT. Indosat (2003-2004), Komisaris PT. Bakrie & Brothers (2006), Komisaris PT. Danareksa (2008), Staf Khusus Menteri Urusan Ekonomi (2004-2009), dan Anggota Dewan Riset Nasional, Kementerian Riset dan Teknologi (2004-2009). Belakangan ini, ia menjabat sebagai Wakil Presiden Asisten Khusus (2009-sekarang). Pada tahun 2010, Mohamad Ikhsan diangkat sebagai Profesor Penuh di Fakultas Ekonomi dan Bisnis, Universitas Indonesia.