Untuk mempermudah pengaturan manajemen proyek penelitian dengan topik yang bermacam-macam, LPEM FEB UI memiliki tujuh kelompok kajian:

1. Grup Penelitian Sumber Daya Alam dan Energi
2. Grup Penelitian Kebijakan Makro, Keuangan, dan Ekonomi Politik
3. Grup Penelitian Perubahan Lingkungan dan Iklim
4. Grup Penelitian Transformasi Digital dan Kajian Perilaku
5. Grup Penelitian Iklim Usaha dan Rantai Nilai Global
6. Grup Penelitian Rekayasa Sosial dan Pemberdayaan Masyarakat
7. Grup Penelitian Perlindungan Sosial dan Tenaga Kerja
8. Group Penelitian Keuangan Publik dan Perencanaan Pembangunan
9. Group Penelitian Bidang Gender dan Inklusi Ekonomi-Sosial
10. Group Penelitian Transportasi, Real Estate, dan Studi Perkotaan

Setiap kelompok kajian, yang dipimpin oleh satu peneliti senior, memiliki tanggung jawab untuk mengadakan proyek-proyek penelitian berdasarkan spesialisasi masing-masing.